この記事の動画の場合は、Cheetah3D でレンダリングした２つのアニメーションファイルを After Effects で処理しているだけなんです。
After Effects 内でオブジェクトを直接読み込むやり方はちょっとわかりませんでした。何かプラグイン等がありそうですけど。 :-!

とりあえずは、Cheetah3D 内で動画をレンダリングして、After Effects でその他素材の合成などの後処理をする感じになるでしょうか。Cheetah3D のカメラ位置情報を書き出し・読み込みはスクリプトで出来そうな気もします…。

お役に立てずすみません。またよろしくお願いしますね。

なるほど、よくわかりました。そういうことなんですね。
もう少し勉強していってみようと思います。

ありがとうございます。